Há quarenta anos, Jim foi responsável pela morte de um garoto parecido com Sora. Por esse motivo, ele se tornou guardião das duas crianças. Sora vai embora com o antigo parceiro de pesquisas de Jim, o genial Anglade. “Preciso fazer alguma coisa”. Ruka, ao lado de um desanimado Umi, parte em busca de Sora e Anglade. A calmaria se transforma em tempestade.