Padre Pio sob investigação: a "autobiografia" secreta é um livro fluente, instigante, repleto de detalhes enriquecedores sobre a vida de um dos santos mais populares dos últimos anos. A obra é dividida em três partes, e quase se pode dizer que são três livros em um. Inicia-se com um longo prefácio de Vittorio Messori, escritor e jornalista italiano, que situa e contextualiza a publicação sua importância. Na primeira parte, o autor traz um resumo dos fatos e da vida de Padre Pio, descrevendo não só as etapas da vida (infância, juventude, ingresso na vida religiosa) como os abundantes dons e graças do capuchinho. Na segunda, são transcritos os textos inéditos da investigação de Dom Raffaello Carlo Rossi, visitador apostólico, redigidos por ordem do Santo Ofício. Inicia-se com considerações pessoais do visitador e, na sequência, é feita a transcrição literal dos depoimentos das pessoas que se relacionavam mais proximamente com Padre Pio. Riquíssimos são os cinco depoimentos do próprio Padre Pio, relatando detalhes dos estigmas, bem como de sua vida cotidiana no convento. Na terceira parte, são apresentados alguns textos mais breves de aprofundamento, como a própria Cronistoria di P. Pio, feita por um dos diretores espirituais de Pe. Pio, o Padre Benedetto Nardella de San Marco in Lamis. São também textos quase que completamente inéditos e de notável valor documental, pois, uma vez que foram mantidos em sigilo, não se incluíram entre as fontes presentes nos arquivos de San Giovanni Rotondo, ficando, portanto, esquecidos por um longo tempo, agora redescobertos e publicados.